行政院於19日以秘書長名義發函中央各部會、明令禁止現職軍公教人員申領或持有中國所發居住證，旨在防止中國藉此混淆我國人員的國家認同。行政院強調，政府無法容忍中國以濫發居住證方式誘使我國軍公教人員申領持用，從而混淆我軍公教人員國家認同，更不允許現職軍公教人員配合中國對台統戰作為，對我國家安全與社會安定產生威脅，爰通函禁止現職軍公教人員申領持用居住證。
行政院指出，中國對台灣人民核發之居住證，與各國針對入境長期居留人士所核發的居留證或永久居留證，性質上完全不同。北京當局刻意模糊「居留」與「居住」之概念，誘使台灣人民基於在陸生活便利性而自主申辦；加上近年來中國不斷透過在台之協力者，大肆招攬國人藉赴陸之際濫發居住證，意圖在法律上達成台灣人民自主申請成為中國人民，營造對台行使管轄權假象。
行政院說明，居住證是中國以提供公共服務，將台灣內國化、地方化，製造台灣內部存在大量中國公民之狀態，其目的在鋪墊如欲對台採行非和平手段，可將台灣內部已有相當數量願接受其管轄之公民為理由，對國際主張擁有合法管轄台灣之權力。
行政院強調，按《國防法》、《陸海空軍軍官士官服役條例》、《公務人員任用法》、《教育人員任用條例》、《警察人員人事條例》、《行政院與所屬中央及地方各機關約僱人員僱用辦法》等相關法規，均規定軍公教人員應效忠國家或負有忠誠義務，而為我民主自由憲政運作之基石，從而自應遵守國家法令、依循政府政策，更應積極考量國家整體利益，採取一切有利國家之行為與政策。
最後，行政院指出，按照中方規定，申領持有中國居住證須在當地求學、工作或居住一定期間，行為與我國法令中對軍公教人員需對國家忠誠之要求顯然相悖。為此，行政院通函明定，現職軍公教人員不得申領或持有中國居住證，若違規且未於服務機關、學校清查時據實申報，經查獲後，各用人機關應本於權責依法予以適當處置。
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