馬英九認為，自己是基於中華民國《憲法》賦予總統的責任，總統必須面對並處理即將發生的政治風暴，他才請行政院長江宜樺及總統府副祕書長羅智強共同會商解決之道，是憲法兩位最高行政首長之間的商議，他並未對外公開關說案的任何資訊，當時是以最大限縮、最小侵害態度審慎處理危機，若在有憲政危機時，檢方卻說不能總統與行政院長討論，「難道要總統回家睡大覺嗎？」
馬英九遭控在2013年8月31日將特偵組偵辦立委柯建銘涉嫌關說司法案的祕密事項外洩，檢方起訴後，一審台北地院認定，馬英九針對司法關說案，將偵查機密告知前行政院長江宜樺及總統府副祕書長羅智強，但這是屬於《憲法》第44條行使「院際調解權」範圍，判他無罪。
檢方不服無罪判決上訴高等法院，開庭時馬英九強調，當時是立法院長、在野黨立院大黨鞭、法務部長、高檢署檢察長涉及集體關說司法個案，馬英九強調，他身為總統，必須進行處理。
檢方則認為，馬英九明知案偵仍在偵查中，卻將偵查機密外洩，犯意與犯行明確，應判有罪，此外，檢方也認為，若總統的行政特權及於犯罪偵查資訊，將是總統擴權，等同總統可有偵查權，後果不堪設想。
檢察官認為，同一案件中，洩密共犯前檢察總長黃世銘已遭判有罪確定，但一審誤引《憲法》「院際調解權」，並悖於明確事證及高院認定的前檢察總長黃世銘是受馬教唆的事實，竟判馬英九無罪，全案上訴高等法院後，今改判有罪。
