2019年5月,基隆已婚康姓男公務員與大11歲的失婚婦人小美外遇後分手,去年9月,小美怒告前男友趁她酒醉,把她帶到墓園性侵。檢警調查後認定,案發時2人為男女朋友,且隔了7個月才提告,罪證不足,康男不起訴。
2019年1月,在台北市政府當公務員的女子小愛與張姓人妻的老公開房間,張女抓姦時嗆聲:「要找記者、柯P來!」結果被小愛控告恐嚇,張女不起訴確定。小愛事後怒罵張女:「不要臉!」被法院認定有損張女名譽,判賠3萬元。
2018年7月,新北市徐姓公務員和人妻同事小芬偷情8年,徐男甚至大膽到小芬家接她出遊,遭小芬丈夫起疑,姦情曝光。檢察官依女方指證徐男下體有明顯黑痣並當庭勘驗確認,成為偷情鐵證,徐男被依通姦罪判刑8個月定讞。
公務員偷情案例多,柯市府幕僚的爭議也不少。2016年6月,柯市府針對大巨蛋調查報告洩密案,進行內部測謊,對外宣稱拒絕測謊而離職的黃姓男幕僚,傳出真正離職的原因是洩漏柯文哲不公開行程給某電視台女主播,做為「把妹」工具,才被柯P趕離台北市政府。
2015年9月,柯文哲競選台北市長時的幕僚、前悠遊卡公司董事長戴季全,因推出日本AV女優波多野結衣悠遊卡,引發爭議,戴多次說此專案為「員工提議」,之後在電台專訪時不慎透露自己才是始作俑者,最後黯然下台。
同年9月,前台北市政府市長室邱姓專員在柯文哲競選台北市長時,擔任柯辦的網路議題分析小組成員,並負責人事招募業務。但他進入北市府後沒多久,就爆發替友人「喬」替代役的弊端,最後邱閃電辭職離開市府。
2015年3月,柯文哲競選台北市長期間的隨行秘書范揚杰,遭爆向遠雄拿10萬元「喬」大巨蛋移樹之事,范否認。柯表示:「都知道了,不是我們的人,去年開除了。」遠雄集團則強調,絕不會跟任何人私下協調這種事情。