隨著BNT／輝瑞疫苗陸續到貨，台灣近日也將正式開打，並依照原本計劃先開放給12到17歲學童優先造冊接種，隨後則是18到22歲的大學生族群。不過有鑒於近日新北幼兒園和集合大樓之群聚案發生，許多學校已經陸續停課，對此陳時中則表示，若是單純停課在家的學生依然可以打疫苗，但如果是被隔離的學生則需要等隔離結束再施打，至於確診者依照指引是要6個月後再接種。
不過，由於BNT疫苗有可能引發副作用「心肌炎」等因素，因此不少家長仍在評估是否要讓小孩施打，陳時中則回應，心肌炎發生的機率極低，希望家長仔細閱讀說明書後，再跟小孩討論。指揮中心發言人莊人祥也說明，據9月8日更新的資料，目前台灣僅有10例施打疫苗後出現心肌炎的個案，分別為9例AZ、1例莫德納，不過AZ與心肌炎是否有正相關還有待觀察。
此外，先前網紅「四叉貓」劉宇8月23日接種了第一劑高端疫苗後，15天後也就是昨（7日）自費前往禾馨診所檢驗抗體，結果顯示以參考數值50來說的話，他的IgG數值是35.4 AU/mL，抗體數值偏低。不過四叉貓也稱50應該是要打過2劑疫苗的數字，而他有朋友同樣打過一劑高端疫苗去檢疫，抗體數值已經達標。
對此，今日陳時中被問及此事則表示，通常來說以個案來談論通案並不符科學精神，打疫苗本來就是依不同人抗體產生也會有差異，打疫苗沒有反應的人也很多，自己以前打B肝的疫苗就是沒有反應的人那類，而根據檢驗方法不同，檢驗結果也會不同。
醫療應變組副組長羅一鈞也進一步解釋，疫苗本來就是要打第二劑後加強免疫系統反應，才會具有更強的保護力與產生更多抗體，因此測出來沒有抗體是意料中的事情，只要按照正常接種模式完成就可以取得完整保護力。而用參考值50來切分，50以上算陽性、以下算陰性是可以，但抗體是持續上升和變化的，只看一個切點無法看出太好的意義。
羅一鈞也說明，現在市面上普遍的抗體檢驗主要都不是針對「疫苗抗體」做得檢驗，以他們公衛上的使用方法，也是像是去驗幼兒園的小朋友是否有被感染，以及感染時間為多久，而不是檢測疫苗的效果。想要看血液抗體與疫苗的關聯，還是需要讓有專業疫苗知識背景的人去判讀會比較準確。
