面對嚴峻的COVID-19疫情，台灣是否要與病毒共存，鄭運鵬今於臉書po文坦言，這不是民調的高低問題，他提出4項重點讓大家思考，首先是在疫情控制方面，大家的態度應該是主動積極的，「正如王必勝指揮官的說明：『清零是我們工作的態度』，這裡的我們指的不是政府和防疫相關人員，而是每個國民」，大家應做好能做的防疫工作，例如戴口罩、勤洗手、保持社交距離，以及接種疫苗等等，「畢竟，再怎麼低的重症死亡率，染病都不會是好事」。
第2點，鄭運鵬認為，即使要與病毒共存，「這不是『求仁得仁』的事情，中央和地方政府的態度應該是『被動消極』的，輿論更不需要主動要求政府接受『我們來和病毒共存吧！』」。他也提到，各種主動開放邊境、降低匡列隔離天數、輕症不需住院等等要求，都必須思考「有國人會因此染疫病逝的責任」，像是先前英國一開始就放掉控制，累計染疫死亡人數近15萬人（總人口約6,700萬），換算成台灣等於有5萬人死亡，「這樣的結果對台灣的特殊國內外處境來說，民進黨下台事小，這種恐慌是會走向亡國的」。
鄭運鵬提到第3點，現在的確有些變數讓疫情沒那麼恐怖，例如台灣整體疫苗的覆蓋率、Omicron的重症和死亡率大幅降低，「但如果不是在台灣全國主動積極防疫之下卻還是失控，不然，國人實在不應該、也不需要主動要求與病毒共存」。
最後一點，鄭運鵬坦言，自己在理性和科學上都可接受與病毒共存的結果，但應該是被動、無奈、漸進的結果，這樣才不會導致太大的國情變動，「如果真的發生這些狀況，而且主要往來國家（日本、美國、中國、東南亞、歐盟等）都開放邊境了，我們再來討論」。
