《看見台灣》一度讓行政院正視國土保育的問題，但3年多過去了，清境地區110家民宿，只有6家沒有違章建築，其他104家均有違法增建或擴建，南投縣政府卻以維持現狀做為指導方針，並無積極作為。
《看見台灣》上映後，時任內政部長的李鴻源在2013年12月公布，清境農場周邊134家民宿，僅有4家完全合法，但最後只有7家被勒令停業。當時新聞炒得沸沸揚揚，但地方民宿業者反彈聲浪大，整件事最後不了了之。
就在大家逐漸淡忘清境違法民宿之際，監察院在今年3月9日提案糾正南投縣政府，針對清境地區民宿違反土地使用管制情形，未落實定期實施全面性土地使用現狀調查及管制，且對「清境地區違規聯合稽查小組」巡查結果未積極裁處，任憑該地區土地違規使用情形持續存在，明顯怠忽職守。
監察院調查，清境地區的民宿中，整棟都是違章建築者高達60家，甚至有5家未領有建築執照，18家未領有民宿登記證。其中核准經營客房數共454間，但實際經營客房數高達1427間，約3分之2屬違規經營。
監察院發現，南投縣政府觀光處統計2011年至2015年依違反《觀光發展條例》裁處者，僅有擴大經營43件、無照經營23件，其他1件為消費爭議、1件為停業未報，裁處案件偏少，且經裁處禁止經營者，縣府後續未追蹤列管，不僅持續違規經營，甚至有擴大營業的情形，但縣府卻以人力有限為由，僅能在1、2年後再次裁罰，毫無嚇阻作用。
加上1950年代，政府為安置上山開闢橫貫公路的榮民，在1500公尺以上的高山設置3座農場，輔導榮民種植溫帶水果，隨著農民經濟改善，下一代有能力下山生活，政府原本照顧榮民的好意，卻埋下破壞水土重要惡果，高山水果、高冷蔬菜的好利潤，長年吸引更多人上山擴墾、超限使用。
