攤開地圖，從雅加達周遭地勢，不難發現這是一塊濱海的沼澤平原，由吉利翁河等13條河川的下游共同沖積而成。河水從雅加達南方火山群一路順地勢而下，流經雅加達市區，最後再匯入雅加達灣。
河水替城市聚落帶來了生機，也是雅加達得以蓬勃發展，成為印尼第一大城的幕後功臣。但近幾年雅加達市民開始察覺到情況不對勁，隨著極端氣候愈見頻繁，街道幾乎逢雨必淹，某些地區甚至長期積水不退。市府單位勘災過後，才發現暴漲河水到了入海前的最後一哩路，竟無法宣洩而出，導致河水漫過了河岸，水淹民宅。
河水為何流不進海裡？原來，雅加達濱海地區的海拔高度已經超過了市區，但並非海岸線「長高」，而是市區地層經年累月不斷下陷，才使得海岸的地勢相對升高，河水無法順勢入海。
「雅加達就像是一個碗，而這個碗正在下沉，」世界銀行的水資源專家Fook Chuan Eng如此形容。
為了引導河水入海，印尼當局修建了多條運河，設法讓盆地裡的積水能循低處入海。但問題是即便廣建運河也僅能指標而不能治本，因為整個雅加達市區仍然在緩慢下陷，不管是河川、河岸、岸旁港埠、魚塭、商家、民宅、貧民窟或高檔豪宅，甚至是那一道阻隔海水漫進市區的濱海堤防，全部都跟著地層崩塌，一起下沉。
「每當大潮來臨，岸邊船隻幾乎就漂浮在海堤的頂端，從我們家門口就可以看到那些船，」住家緊鄰雅加達灣的穆拉巴姆村民說。
4月底，印尼政府決意遷都的消息，引來國際上的普遍關注，許多人把此一事件和氣候變遷、地球暖化做連結，認為海平面上升是印尼當局痛下決心的最大原因。但實際上，雅加達所面臨到的危機是雙重的，比海水倒灌更根本也更深遠的問題，是地處低窪的雅加達正因為超抽地下水，越陷越深。
「這問題已經持續很長一段時間，」長期研究雅加達地層下陷的美國奧瑞岡州大學地球科學教授Estelle Chaussard說：「當你從鬆軟的土地裡抽走水分，地質結構就會崩塌，這種下陷的情形是不可逆的。」
