《諸葛四郎》漫畫共有16部，篇幅達1萬6,000多頁，改編難度高。林于竣表示：「《大戰魔鬼黨》《大鬥雙假面》這兩部情節非常精彩，但我看的時候有個疑問，諸葛四郎跟真平到底怎麼認識的？」於是他將《大戰魔鬼黨》《大鬥雙假面》的內容結合，以「前傳」的概念發想出劇本，除擷取漫畫經典元素，如：內賊、機關、武打等，更保留《諸葛四郎》的核心價值。
1981年，張艾嘉悠悠唱出〈童年〉歌詞中的「諸葛四郎和魔鬼黨，到底是誰搶到那支寶劍」。但《大戰魔鬼黨》中，諸葛四郎與魔鬼黨搶的不是寶劍，而是山寨機關地形圖。不過因舞台劇將《大戰魔鬼黨》《大鬥雙假面》合而為一，竟讓傳唱逾30年的「美麗的錯誤」成真。葉佳龍說：「紙風車做了一件很了不起的事，捉住漫畫的幾個重點重新組合。」而動畫版劇情也以舞台劇版為基底，凸顯角色的性格，加強特效、闖關關卡、機關等設計。
林于竣強調，葉宏甲的創作有其獨特時代性，無論舞台劇或電影版只是改變說故事的方式、透過技術及形式的轉換，符合現代的節奏，但作品的情感和精神不變。「為什麼動畫取名為《英雄的英雄》？因為英雄不只是表面的勇敢。電影中，我們賦予諸葛四郎一個精神：不只英勇神武還能捨身取義。」
