依據疾管署監測資料顯示，第40週（9月28日至10月4日）門急診就診計8,484人次，與前一週（8,537人次）相當；近四週實驗室監測顯示社區腸病毒以克沙奇A16型為多，其次為克沙奇A6型及伊科病毒11型；近期伊科病毒11型檢出數下降，惟仍可能出現重症病例。
另外，今年累計17例腸病毒感染併發重症確定病例（含8例死亡），為近6年同期最高；其中新生兒腸病毒感染併發重症確定病例累計14例，均感染伊科病毒11型，其中7例死亡；目前社區中持續有腸病毒疫情傳播風險，呼籲民眾留意新生兒及幼童腸病毒重症前兆病徵。
疾管署表示，連假期間民眾出遊往來機會增加，也提高腸病毒傳播的機會，家長帶孩童出入人多擁擠、互動頻繁的場所如室內兒童遊戲場，應教導孩童注意使用設施前後應以肥皂正確洗手。
疾管署說，此外，對於兒童常出入之公共場所，業者應定期就幼童常接觸物體表面進行消毒，須注意酒精對腸病毒之消毒效果有限，建議可使用濃度500 ppm的含氯漂白水（10公升清水+100毫升市售家庭用漂白水）進行一般環境消毒，並注意環境通風，環境、器具等用消毒水擦拭完畢後，靜待10分鐘再用清水擦拭一次，即可完成消毒。
呼籲民眾，新生兒感染腸病毒可能會出現發燒或低體溫、活力不佳、喝奶量變少等情形，且病程發展快速，未及時治療可能迅速發展為心肌炎、肝炎、腦炎、多發性器官衰竭等重症，嚴重可能威脅生命，一旦有上述症狀，務必儘速就醫。
