環保案件不好偵辦，除了因利益龐大而牽涉到諸多盤根錯節問題，鄭智文說，法令不周，也是原因，例如3年前他偵辦電鍍廠污染案時，《水污染防治法》大部分條文都只有行政裁罰，業者不痛不癢，僅第36條等少數條文提及刑罰，讓檢方有著力處，但，條文為：事業無排放許可證或簡易排放許可文件，「且」其排放廢水所含之有害健康物質超過放流水標準者，處負責人3年以下有期徒刑…。
鄭智文解釋：「意思是只要工廠有裝設污染防制設備，有拿到排放許可證，就算不使用污染防治設備，也沒事。」
他說，不少電鍍工廠便是如此，即使裝了污水處理設備，但由於每次處理廢水所需添加的化學藥劑很貴，不少工廠便私接暗管，長年將未經處理的有毒廢水，透過暗管排放至溪河甚至灌溉渠道，污染農田及稻米。
直到2013年底，《水污染防治法》第36條終於修正為「事業注入地下水體、排放於土壤或地面水體之廢（污）水所含之有害健康物質超過本法所定各該管制標準者，處三年以下有期徒刑…」，補足漏洞。
「可是政府就是頭痛醫頭，腳痛醫腳！」鄭智文說，修了《水污染防治法》，但有同樣漏洞的《空氣污染防治法》還是沒修，第48條：「無空氣污染防制設備而燃燒易生特殊有害健康之物質者，處三年以下有期徒刑…」仍讓業者有漏洞可鑽，只要裝了空氣污染防制設備，即使排放毒氣，檢察官也沒轍。
鄭智文說，例如今年偵辦的某科技公司空污案，他透過採集當地土壤、落葉等方式，發現這裡的土壤及落葉竟含世紀之毒戴奧辛，再透過儀器分析，發現這些戴奧辛疑似來自某科技公司排放的氣體。
原來，業者為省成本，使用廢木材做為燃料，但廢木材來源為廢棄傢俱、夾板、三合板等等，表面常有化學塗料或含木材防腐劑，燃燒後會產生有毒物質。但，即使證明工廠廢氣有毒，依照現行的《空氣污染防治法》，檢方仍無力可施。
如此積極偵辦污染案件，鄭智文說，因為很能感同身受，他年輕時曾住在彰化市某間鐵皮屋，洗澡、洗衣服只能用地下水，「洗完澡全身會發癢，衣服越洗越黃。」因為地下水被污染成黃色。
鄭智文又說，自己的母親長年洗腎，父親也罹患舌底癌、肺癌而過世，心中十分難過，雖然無法確定父母罹病是否與環境污染有關，但彰化的農田與稻米長年遭污染卻是事實，「環境對人類很重要，我們辦污染也不是要讓業者倒閉、毀滅經濟，只是要讓產業競爭秩序回復到正常的軌道，不要劣幣驅良幣。」
