指揮中心表示，依全民健康保險法第55、56條及全民健康保險自墊醫療費用核退辦法第3條規定，保險對象於台灣地區外發生不可預期之緊急傷病，包含應立即處理之法定傳染病或報告傳染病，須在當地醫事服務機構立即就醫，可於門、急診治療當日或出院之日起6個月內，向投保單位所在地的健保署分區業務組申請核退費用，健保署將依程序送請專業審查認定，是否屬不可預期之緊急傷病範圍。
指揮中心說明，核退自墊醫療費用之標準，依本保險醫療費用支付及給付規定審查後核實給付，惟訂有上限，以支付國內健保特約醫院及診所之平均費用為基準，最近一季2020年10月至12月份之核退金額上限，門診每次1,053元、急診每次3,160元、住院每日6,042元，故如保險對象出國至醫療費用相對較高的國家，可評估是否加買海外突發疾病醫療險。
保險對象申請自墊醫療費用核退，應檢附自墊醫療費用核退申請書（可至健保署全球資訊網站下載）、醫療費用收據正本及費用明細、診斷書、當次出入境證明文件影本，住院者另檢附出院病歷摘要，另在中國大陸地區住院5日（含5日，但出院日不列入計算）以上的核退申請案件的診斷書及醫療費用收據正本，需先至中國大陸地區公證處辦理公證，再持公證書正本向財團法人海峽交流基金會辦理驗證後，再提出申請。
另因疫情期間保險對象若無法於規定期間返台親自臨櫃申請，亦可採郵寄方式向投保單位所在地之健保署分區業務組申請，並檢附委託書。
