衛福部長陳時中5月出席《再生醫療製劑管理條例》草案公聽會時指出，再生醫療是一個新概念，並表示：「我們站在樂觀其成、積極推動的角度，希望對人民有用的法案能早日通過。」即便如此，醫師出身的民進黨不分區立委邱泰源卻提出另一版本，與衛福部版互槓。
邱泰源認為，再生醫療應該是「製品」，是由醫師打到病患身上，「無需經過中間藥師的調劑階段」，反對衛福部版「製劑」的設計。邱還說，就像輸血不需藥師經手，反對再生醫療相關藥物由藥師主導，因此另推醫師公會版，堅持應由「醫師」主導，主張衛福部不應侷限「製劑」一詞，也不應只由《藥事法》管理。
但衛福部食藥署長吳秀梅不以為然，她表示：「改成製品，再生醫療產品的主管機關就是經濟部了！」同為民進黨的立委邱議瑩也認為，使用「製劑」一詞可回歸《藥事法》管理，「製品」定位模糊，須回頭修數十、數百條法令，再生醫療發展將延宕，講到激動處，她甚至落淚說：「癌症病人根本等不及立委慢慢修法！」
對於相關爭議，代表產業界的「台灣研發型生技新藥發展協會」理事長張鴻仁則認為，邱泰源版執行上有困難。張表示，邱主張要成立一個相當於食藥署的機關管理再生醫療產品，從研發、製造、供應、販售、事後安全性檢測，都由新的委員會審核。
張鴻仁認為，台灣目前法令已經很完備，邱泰源版本若想將再生醫療產品給醫師管，其實也可在現行法規中協調，無需曠日廢時另立新法，影響病患權益。
