在房地合一2.0版本上路之後，預售屋買賣的民眾應注意「持有期間」的認定，近期不乏在預售時期取得，成屋出售因認定期間不同，被迫補稅的例子。
市場上就遇到房地合一稅收的補稅大案，住商不動產企劃研究室資深經理徐佳馨透露，有位民眾在2016年以1.2億元買入北市預售屋，2019年完工交屋，在2022年1月以1.3億元賣出，扣掉過戶等相關費用，實際獲利970萬元。
民眾估算自己買進、賣出的時間點為2016年～2022年1月，持有時間達5年3個月，於是採20％的稅率繳納房地合一稅，申報繳納稅額970萬元X20％=194萬元，但卻被國稅局認定為2019年取得成屋至2021年初賣出，持有期間僅2年3個月，適用稅率以35％計算，也就是應繳納970萬元X35％=339.5萬元，因此必須補稅145.5萬元。
「喬王的投資理財筆記」部落客喬王指出，「房地合一2.0」將重稅的閉鎖期延長至5年，持有預售屋的時間在交屋前後，都要重新起算，因此預售期間轉售獲利，都要依持有年限長短、課重稅達45％～35％，成屋後也有大約5年的重稅閉鎖期，前後加總時間長達7～10年之久。
根據財政部的統計，去年12月的個人房地合一稅收，創下47.3億元歷史新高，打破7月29.2億元的紀錄，稅收表現反映市場景氣熱絡，且出現三多現象：房價漲多、交易多、短期轉手多。
信義房屋不動產企研室專案經理曾敬德提醒，房地合一稅收大幅飆高，背後可能也是短線市場過熱的一種警訊，在升息趨勢下，購屋人應避免將財務槓桿用至極限，同時也要預先試算升息後的房貸負擔。
