由於是文字轉譯圖像，創作過程少不了溝通環節。在已出版的2集漫畫中，鸚鵡洲透露花較多時間溝通的畫面，是如何呈現主角海鱗子在一些回憶情節的幼時樣貌，「一開始不是很清楚每階段的年齡，所以出現的外表有時年紀大一些、有時又小一點，後來與編輯對了時間線，把外表修改了一輪。」
薛西斯花較多心力調整的段落，是在第2集〈惡人正機篇〉中，海鱗子根據死者開槍時機試圖推論幽靈身分。「在原始劇本中這裡的推論細節更多，因果層次更複雜，但在漫畫表現上會顯得太累贅，所以和編輯磨了很久，試圖更精簡。」
鸚鵡洲先前創作較多同人誌，《不可知論偵探》是她首部商業漫畫，「也是邊畫邊摸索」。她認為兩者主要差異，「是將一個故事好好地完整呈現給讀者的能力，這也是我現在最需要的吧！」
薛西斯也分享自己因應這部作品、在創作習慣上做出的改變。「我的作品大部分是篇幅很長、30萬字以上的長篇小說，結構非常複雜，謎團也更迂迴，但很難以單集漫畫長度鋪陳這樣的故事。」
「因此在漫畫上，不論犯罪動機、人物樣貌或謎團層次我都盡可能使之單純、平面化。」薛西斯表示，如果將《不可知論偵探》轉譯為小說，「大概只會是5至6萬字的中短篇程度。」
